Saint-Bertrand-de-Comminges - ou plutôt « Lugdunum » -, est née en 72 avant l'ère chrétienne dans la plaine de Valcabrère qui accueillit en son temps les légionnaires de Pompée. La florissante cité romaine se développe encore au Vème siècle autour d'une basilique paléochrétienne. Des remparts sont alors construits au sommet du site et la population se répartit entre la ville basse et la ville haute. Aujourd'hui, le village a non seulement conservé cette double structure mais aussi de nombreux vestiges du site antique de Lugdunum : thermes du nord, forum, théâtre, grand marché couvert, camp militaire
La construction de la cathédrale est entreprise à la fin du Xème siècle, à l'initiative de l'évêque Bertrand de l'Isle qui meurt en 1123. La cité épiscopale, prenant le nom de son évêque canonisé en 1222, devient Saint-Bertrand-de-Comminges et attire les premiers pèlerins. Le village devient un haut lieu de pèlerinage sous l'impulsion de l'évêque Bertrand de Got, futur pape Clément V, qui décide de transformer la cathédrale et d'y installer les reliques de son prédécesseur dans un reliquaire bien en vue afin de faciliter la vénération des fidèles. L'établissement, au XVIème siècle, de la confrérie de Saint-Bertrand au sein de la cathédrale, assure le rayonnement de la cité épiscopale jusqu'à la suppression du diocèse de Comminges en 1793.